MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Thunder Bay

Total Repeats: 64558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021350	ACT	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509149354
2	NC_021350	TTG	2	6	687	692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149354
3	NC_021350	AGC	2	6	757	762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149354
4	NC_021350	TTA	2	6	771	776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149354
5	NC_021350	TCGTT	2	10	785	794	0 %	60 %	20 %	20 %	509149354
6	NC_021350	T	8	8	815	822	0 %	100 %	0 %	0 %	509149354
7	NC_021350	GTAG	2	8	885	892	25 %	25 %	50 %	0 %	509149354
8	NC_021350	CTG	2	6	919	924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509149354
9	NC_021350	A	6	6	972	977	100 %	0 %	0 %	0 %	509149354
10	NC_021350	TAAA	2	8	1003	1010	75 %	25 %	0 %	0 %	509149354
11	NC_021350	A	6	6	1008	1013	100 %	0 %	0 %	0 %	509149354
12	NC_021350	TTAT	3	12	1110	1121	25 %	75 %	0 %	0 %	509149354
13	NC_021350	G	7	7	1122	1128	0 %	0 %	100 %	0 %	509149354
14	NC_021350	CATG	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	509149354
15	NC_021350	AAT	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149354
16	NC_021350	GTATT	2	10	1200	1209	20 %	60 %	20 %	0 %	509149354
17	NC_021350	TTG	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149354
18	NC_021350	CAAA	2	8	1251	1258	75 %	0 %	0 %	25 %	509149354
19	NC_021350	TGA	2	6	1310	1315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149354
20	NC_021350	T	6	6	1323	1328	0 %	100 %	0 %	0 %	509149354
21	NC_021350	T	6	6	1356	1361	0 %	100 %	0 %	0 %	509149354
22	NC_021350	TTGG	2	8	1465	1472	0 %	50 %	50 %	0 %	509149354
23	NC_021350	CG	3	6	1510	1515	0 %	0 %	50 %	50 %	509149354
24	NC_021350	ATTA	2	8	1523	1530	50 %	50 %	0 %	0 %	509149354
25	NC_021350	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	509149354
26	NC_021350	TCT	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509149354
27	NC_021350	AGTT	2	8	1723	1730	25 %	50 %	25 %	0 %	509149354
28	NC_021350	A	6	6	1747	1752	100 %	0 %	0 %	0 %	509149354
29	NC_021350	TAAAG	2	10	1769	1778	60 %	20 %	20 %	0 %	509149354
30	NC_021350	AATGGC	2	12	1832	1843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	509149354
31	NC_021350	GGT	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	509149354
32	NC_021350	GAT	2	6	1956	1961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149354
33	NC_021350	TCT	2	6	2004	2009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509149354
34	NC_021350	A	6	6	2044	2049	100 %	0 %	0 %	0 %	509149355
35	NC_021350	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149355
36	NC_021350	T	6	6	2124	2129	0 %	100 %	0 %	0 %	509149355
37	NC_021350	AAAAC	2	10	2325	2334	80 %	0 %	0 %	20 %	509149355
38	NC_021350	CTG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509149355
39	NC_021350	TAG	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149355
40	NC_021350	ATG	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149355
41	NC_021350	TTG	2	6	2431	2436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149355
42	NC_021350	CAG	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149355
43	NC_021350	ATT	2	6	2499	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149355
44	NC_021350	ATT	2	6	2524	2529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149355
45	NC_021350	TAA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149355
46	NC_021350	CAAA	2	8	2593	2600	75 %	0 %	0 %	25 %	509149355
47	NC_021350	A	6	6	2614	2619	100 %	0 %	0 %	0 %	509149355
48	NC_021350	ATT	2	6	2631	2636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149355
49	NC_021350	ATT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149355
50	NC_021350	TTG	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149355
51	NC_021350	CAAT	2	8	2709	2716	50 %	25 %	0 %	25 %	509149355
52	NC_021350	AATT	2	8	2732	2739	50 %	50 %	0 %	0 %	509149355
53	NC_021350	AG	3	6	2776	2781	50 %	0 %	50 %	0 %	509149355
54	NC_021350	ATTG	2	8	2800	2807	25 %	50 %	25 %	0 %	509149355
55	NC_021350	TTG	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149355
56	NC_021350	ACA	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509149355
57	NC_021350	AAT	3	9	2911	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149355
58	NC_021350	AAG	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149355
59	NC_021350	TGA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149355
60	NC_021350	ATT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149355
61	NC_021350	ATT	2	6	3303	3308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149356
62	NC_021350	ACG	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149356
63	NC_021350	CA	3	6	3392	3397	50 %	0 %	0 %	50 %	509149356
64	NC_021350	TAC	2	6	3425	3430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509149356
65	NC_021350	ATT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149356
66	NC_021350	GCTT	2	8	3517	3524	0 %	50 %	25 %	25 %	509149356
67	NC_021350	GTT	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149356
68	NC_021350	ATT	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149356
69	NC_021350	TTA	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149356
70	NC_021350	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	509149356
71	NC_021350	AT	3	6	3751	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	509149356
72	NC_021350	A	6	6	3791	3796	100 %	0 %	0 %	0 %	509149356
73	NC_021350	GGA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	509149356
74	NC_021350	TGATAG	2	12	3836	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149356
75	NC_021350	A	7	7	3848	3854	100 %	0 %	0 %	0 %	509149356
76	NC_021350	TA	3	6	3856	3861	50 %	50 %	0 %	0 %	509149356
77	NC_021350	CT	3	6	3927	3932	0 %	50 %	0 %	50 %	509149356
78	NC_021350	ACA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509149356
79	NC_021350	A	6	6	3943	3948	100 %	0 %	0 %	0 %	509149356
80	NC_021350	TGA	2	6	4013	4018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149356
81	NC_021350	GCT	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509149356
82	NC_021350	TTAA	2	8	4056	4063	50 %	50 %	0 %	0 %	509149356
83	NC_021350	AAC	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509149356
84	NC_021350	AAT	2	6	4116	4121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149356
85	NC_021350	GTTT	2	8	4147	4154	0 %	75 %	25 %	0 %	509149356
86	NC_021350	TGA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
87	NC_021350	ATA	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149357
88	NC_021350	GAT	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
89	NC_021350	CAT	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509149357
90	NC_021350	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
91	NC_021350	GAA	2	6	4743	4748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149357
92	NC_021350	GCT	2	6	4758	4763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509149357
93	NC_021350	TGA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
94	NC_021350	AGA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149357
95	NC_021350	CA	3	6	4982	4987	50 %	0 %	0 %	50 %	509149357
96	NC_021350	TGA	2	6	5105	5110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
97	NC_021350	A	6	6	5121	5126	100 %	0 %	0 %	0 %	509149357
98	NC_021350	GGC	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	509149357
99	NC_021350	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149357
100	NC_021350	TAAA	2	8	5173	5180	75 %	25 %	0 %	0 %	509149357
101	NC_021350	GTT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149357
102	NC_021350	ATG	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
103	NC_021350	AAC	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509149357
104	NC_021350	TGG	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	509149357
105	NC_021350	AGC	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149357
106	NC_021350	AAT	2	6	5367	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149357
107	NC_021350	TGA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
108	NC_021350	CAG	2	6	5527	5532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149357
109	NC_021350	GCA	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149357
110	NC_021350	ATT	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149357
111	NC_021350	GCA	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149357
112	NC_021350	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	509149357
113	NC_021350	GCG	2	6	5642	5647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	509149357
114	NC_021350	CTG	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509149357
115	NC_021350	TCT	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509149357
116	NC_021350	AAG	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149357
117	NC_021350	ATC	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509149357
118	NC_021350	CTT	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509149357
119	NC_021350	AG	3	6	6042	6047	50 %	0 %	50 %	0 %	509149357
120	NC_021350	AT	3	6	6062	6067	50 %	50 %	0 %	0 %	509149357
121	NC_021350	ACC	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	509149357
122	NC_021350	TAAAG	2	10	6092	6101	60 %	20 %	20 %	0 %	509149357
123	NC_021350	GAT	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149357
124	NC_021350	GAA	2	6	6228	6233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149357
125	NC_021350	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149357
126	NC_021350	TGC	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509149357
127	NC_021350	AAG	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149357
128	NC_021350	ACA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509149357
129	NC_021350	A	7	7	6677	6683	100 %	0 %	0 %	0 %	509149357
130	NC_021350	ACAA	2	8	6686	6693	75 %	0 %	0 %	25 %	509149357
131	NC_021350	AAC	2	6	6743	6748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509149357
132	NC_021350	ACC	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	509149357
133	NC_021350	AAG	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509149357
134	NC_021350	GTT	3	9	7297	7305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509149358
135	NC_021350	ACC	4	12	7322	7333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	509149358
136	NC_021350	GA	3	6	7479	7484	50 %	0 %	50 %	0 %	509149358
137	NC_021350	GGT	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	509149358
138	NC_021350	GAT	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149358
139	NC_021350	TAA	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149358
140	NC_021350	TCA	2	6	7695	7700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509149358
141	NC_021350	ATA	2	6	7725	7730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509149358
142	NC_021350	TAAT	2	8	7746	7753	50 %	50 %	0 %	0 %	509149358
143	NC_021350	AACA	2	8	7806	7813	75 %	0 %	0 %	25 %	509149358
144	NC_021350	ACC	2	6	7859	7864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	509149358
145	NC_021350	TTA	2	6	7909	7914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149358
146	NC_021350	ATT	2	6	8006	8011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509149358
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148	NC_021350	GCCAT	2	10	8233	8242	20 %	20 %	20 %	40 %	509149358
149	NC_021350	CAG	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509149358
150	NC_021350	TATTCA	2	12	8305	8316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	509149358
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152	NC_021350	CTT	2	6	8360	8365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509149359
153	NC_021350	TAAG	2	8	8374	8381	50 %	25 %	25 %	0 %	509149359
154	NC_021350	AG	3	6	8380	8385	50 %	0 %	50 %	0 %	509149359
155	NC_021350	TAAT	2	8	8412	8419	50 %	50 %	0 %	0 %	509149359
156	NC_021350	CGC	2	6	8490	8495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	509149359
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158	NC_021350	CAT	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509149359
159	NC_021350	ACCA	2	8	8602	8609	50 %	0 %	0 %	50 %	509149359
160	NC_021350	A	6	6	8825	8830	100 %	0 %	0 %	0 %	509149359
161	NC_021350	CATT	2	8	8861	8868	25 %	50 %	0 %	25 %	509149359
162	NC_021350	TTC	2	6	8902	8907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509149359
163	NC_021350	TA	3	6	9036	9041	50 %	50 %	0 %	0 %	509149359
164	NC_021350	ATC	2	6	9106	9111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509149359
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167	NC_021350	CTT	2	6	9243	9248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509149359
168	NC_021350	ATG	2	6	9272	9277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149359
169	NC_021350	CAA	2	6	9291	9296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509149359
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171	NC_021350	TGCA	2	8	9428	9435	25 %	25 %	25 %	25 %	509149359
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173	NC_021350	TTTGA	2	10	9643	9652	20 %	60 %	20 %	0 %	509149359
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176	NC_021350	CAATAA	2	12	9699	9710	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	509149359
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252	NC_021350	TGA	2	6	15047	15052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509149365
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263	NC_021350	ACC	2	6	15839	15844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	509149366
264	NC_021350	T	8	8	15848	15855	0 %	100 %	0 %	0 %	509149366
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